硫酸軟骨素存在于從線蟲到人除植物外的所有生物中，發(fā)揮著許多重要的生理功能。雖然多糖的主鏈結(jié)構(gòu)并不復(fù)雜，但就硫酸化程度、硫酸基和兩種差異向異構(gòu)糖醛酸再鏈內(nèi)的分布來說，呈現(xiàn)高度的不均一性。硫酸軟骨素的精細結(jié)構(gòu)決定著功能的特異性和與多種蛋白質(zhì)分子的相互作用。

1、在醫(yī)學(xué)上主要的應(yīng)用途徑是作為治療關(guān)節(jié)疾病的藥品，與氨基葡萄糖配合使用，具有止痛，促進軟骨再生的功效，可以從根本改善關(guān)節(jié)問題。提供墊襯作用，緩和行動時的沖擊和摩擦，能將水分吸入蛋白多糖分子內(nèi)，使軟骨變厚，并增加關(guān)節(jié)內(nèi)的滑液量。軟骨素的重要功能之一就是作為輸送管道，把重要的氧供和營養(yǎng)素輸送至關(guān)節(jié)，幫助清除關(guān)節(jié)內(nèi)的廢物，同時把二氧化碳和廢物加以排除。由于關(guān)節(jié)軟骨并無血液供應(yīng)，因此所有的充氧、滋養(yǎng)及潤滑作用皆來自滑液。
2、硫酸軟骨素對角膜膠原纖維具有保護作用，能促進基質(zhì)中纖維的增長，增強通透性，改善血液循環(huán)，加速新陳代謝，促進滲透液的吸收及炎癥的消除；其聚陰離子具有強的保水性，能改善*組織的水分代謝，對角膜有較強的親和力，能在角膜表面形成一層透氣保水膜，改善眼部干燥癥狀。通過促進基質(zhì)的生成，為細胞的遷移提供構(gòu)架，有利于角膜上皮細胞的遷移，從而促進角膜創(chuàng)傷的愈合，滲出液的吸收及炎癥的消除。
3、通過高科技深加工，可以治療神經(jīng)性頭疼、三叉神經(jīng)痛、冠心病、心絞痛、心肌缺氧、心腦血管疾病、關(guān)節(jié)痛、動脈粥樣硬化及肝炎等癥，其中CS還具有抗凝和*形成的作用，也可用于因鏈霉素引起的聽覺障礙和*功能受損的輔助治療以及高血脂的輔助治療。
4、可以作為保健品、食品中的添加劑，具有增強人體體質(zhì)及抗病菌、美容、抗衰老等作用。改善聽力和肌膚干燥。在體內(nèi)可抑制小腸對脂質(zhì)和葡萄糖的吸收以達到*作用。

硫酸軟骨素是糖胺聚糖的一種，由D-葡糖醛酸和N-乙酰氨基半乳糖以β-1,4-糖苷鍵連接而成的重復(fù)二糖單位組成的多糖，并在N-乙酰氨基半乳糖的C-4位或C-6位羥基上發(fā)生硫酸酯化。 硫酸軟骨素是從動物組織中提取制備的酸性粘多糖類物質(zhì)，為白色或類白色粉末；特殊性氣味；有引濕性。本品的水溶液具粘稠性，加熱不凝結(jié)。本品在水中易溶，不溶于乙醇、丙酮等有機溶劑中，其鹽類對熱較穩(wěn)定，受熱達80℃亦不被破壞。硫酸軟骨素水溶液，遇較高溫度或酸即不穩(wěn)定，主要是脫乙酰基或降解成單糖或分子量較小的多糖。