目前，化肥被大量施用以保持農(nóng)林業(yè)高產(chǎn)。但是，隨著化肥用量不斷增加，土壤開始板結(jié)，化肥淋入地下水也將造成水污染。近年來，我國提倡有機(jī)農(nóng)業(yè)，大量應(yīng)用有機(jī)肥，達(dá)到保持作物產(chǎn)量的同時，保護(hù)土地和環(huán)境。畜禽糞便是有機(jī)肥重要來源，2016年我國僅養(yǎng)殖肉牛產(chǎn)生的牛糞就達(dá)到15萬噸以上，為我國有機(jī)肥生產(chǎn)提供了充足的原料。另外，我國小麥歷年種植面積為我耕種地總面積的22％～30％，產(chǎn)生大量小麥秸稈，秸稈為養(yǎng)殖業(yè)提供飼料，也為有機(jī)肥生產(chǎn)提供了豐富原料。但是，豐富的原料只是生產(chǎn)的基礎(chǔ)，重要的是對這些原料的加工利用。其中關(guān)鍵的是有機(jī)肥原料的發(fā)酵腐熟技術(shù)不斷發(fā)展與創(chuàng)新。

生物菌肥是一種由生物菌種（如細(xì)菌、真菌等）經(jīng)過發(fā)酵或培養(yǎng)后制得的肥料。它通常包含大量的活性微生物，這些微生物能夠分解有機(jī)物質(zhì)，提供植物所需的營養(yǎng)元素，并促進(jìn)植物生長。 生物菌肥具有以下特點：
1. 提供多種養(yǎng)分：生物菌肥中含有豐富的有機(jī)質(zhì)和微量元素，這些養(yǎng)分對植物生長發(fā)育至關(guān)重要。
2. 促進(jìn)土壤生物活性：生物菌肥中的活性微生物能夠分解有機(jī)物質(zhì)，釋放出更多的養(yǎng)分，并促進(jìn)土壤中其他微生物的繁殖和活動，改善土壤質(zhì)地和結(jié)構(gòu)。
3. 增強(qiáng)植物力：生物菌肥中的益生菌能夠與植物形成共生關(guān)系，提高植物的抗病能力，減少病蟲害的發(fā)生。
4. 環(huán)境友好：生物菌肥不含化學(xué)合成的肥料成分，對環(huán)境污染較小，使用后不會對土壤和水體造成負(fù)面影響。

微生物代謝物有直接殺菌的作用且進(jìn)入土壤會在根際定殖，搶占生態(tài)位點讓線蟲及真無法侵染。有益微生物進(jìn)入土壤會在根系周圍產(chǎn)生大量粘多糖與植物分泌的粘液及礦物膠體、有機(jī)交替相結(jié)合，形成土壤團(tuán)粒結(jié)構(gòu)，提高土壤蓄肥、保水能。